Юрий Козлов является действительным членом Ассоциации сердечно-сосудистых хирургов России, в 2010 году он был признан «Лучшим детским хирургом России», внес значительный вклад в развитие и совершенствование хирургической и неотложной помощи новорожденным детям Приангарья. При его активном участии проведена работа по внедрению новых технологий в практику отделения реанимации новорожденных Ивано-Матренинской детской клинической больницы. Постоянно оказывает лечебно-консультативную экстренную и плановую помощь детям из соседних регионов – Бурятии, Читинской области.